Jauja ist die Hauptstadt der gleichnamigen Provinz in der peruanischen Region Junín. Die Stadt liegt im Tal des Flusses Mantaro in einer Höhe von 3.352 m, 45 km nördlich von Huancayo. Administrativ gliedert sich die Stadt in die drei Distrikte Jauja, Sausa und Yauyos.
In Jauja liegt der regionale Flughafen der Region Junín.
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Koordinaten -11°46'30.981" N -75°30'0.232" E