Merauke ist eine 1902 gegründete Stadt im Regierungsbezirk Merauke in der indonesischen Provinz Papua. Sie liegt im Süden Neuguineas an der Mündung des Flusses Maro in die Arafurasee. Im Hinterland von Merauke liegen die Yos-Sudarso-Insel und die Aroe-Inseln. Sie ist die östlichste Stadt Indonesiens.
Merauke ist Sitz eines Erzbischofs, 2005 feierte die katholische Kirche dort ihr 100-jähriges Jubiläum.
Der Schweizer Völkerkundler Paul Wirz begann 1916 von Merauke aus seine Arbeiten bei den Marind-anim.
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Koordinaten -8°29'24.996" N 140°23'44.095" E