미야코섬은 오키나와섬에서 남서쪽으로 약 300킬로미터 떨어진, 태평양과 동중국해의 사이에 있는 섬이다. 동경 125도, 북위 24도에 위치한다.
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좌표 24°46'24.025" N 125°19'58.825" E